病原微生物檢測(cè) | 納米磁珠助力mNGS
mNGS技術(shù)直接針對(duì)標(biāo)本中核酸無(wú)偏倚檢測(cè)病原微生物序列，提取的核酸及構(gòu)建文庫(kù)的質(zhì)量是mNGS數(shù)據(jù)準(zhǔn)確的關(guān)鍵要素。
01 兒童不明肝炎重癥率達(dá)到10%
2022年4月以來(lái)，世衛(wèi)組織（WHO）5個(gè)區(qū)域的33個(gè)國(guó)家向世衛(wèi)組織報(bào)告了650例病因不明的兒童急性肝炎疑似病例，其中至少38例兒童需要進(jìn)行移植，已向世衛(wèi)組織報(bào)告了9例死亡（媒體公開(kāi)信息報(bào)道）。不斷增長(zhǎng)的不明原因兒童肝炎病例數(shù)，時(shí)刻牽動(dòng)著大家的心。目前，病因尚無(wú)定論，但在致病原因調(diào)查中，腺病毒和新冠病毒被認(rèn)為有很大嫌疑。
02 mNGS是不明病原微生物分析重要手段
2022年4月23日WHO發(fā)布了針對(duì)不明原因兒童急性嚴(yán)重肝炎的診斷建議，但并無(wú)具體診斷和治療方案意見(jiàn)。我國(guó)雖然尚無(wú)相關(guān)病例報(bào)告，國(guó)家重大公共衛(wèi)生事件醫(yī)學(xué)中心組織相關(guān)專(zhuān)家，根據(jù)已有的相關(guān)臨床和實(shí)驗(yàn)室數(shù)據(jù)及新近國(guó)際兒童急性肝衰竭的處置流程或指南，編制了“不明原因兒童嚴(yán)重急性肝炎診斷和治療專(zhuān)家建議”。 經(jīng)普通臨床檢測(cè)仍無(wú)法明確診斷者，需要針對(duì)患者的血液、呼吸道分泌物、糞便、體液、肝穿組織等樣本進(jìn)行病原宏基因組二代測(cè)序（metagenomicnext generation sequencing，mNGS）。
mNGS技術(shù)直接針對(duì)標(biāo)本中核酸無(wú)偏倚檢測(cè)病原微生物序列，提取的核酸及構(gòu)建文庫(kù)的質(zhì)量是mNGS數(shù)據(jù)準(zhǔn)確的關(guān)鍵要素。mNGS檢測(cè)流程基本包括標(biāo)本采集、核酸提取、文庫(kù)制備、上機(jī)測(cè)序、數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)、報(bào)告生成及結(jié)果解讀等一系列過(guò)程（圖1）。其中，核酸提取、PCR產(chǎn)物純化、片段篩選過(guò)程都可以使用納米磁珠實(shí)現(xiàn)高通量、快速和精準(zhǔn)操作。
圖1.mNGS檢測(cè)流程圖
03 樣本處理是mNGS的關(guān)鍵步驟
mNGS檢測(cè)具有獨(dú)特的性質(zhì)：a)可檢測(cè)任意微生物，發(fā)現(xiàn)新的病原微生物; b）客觀檢測(cè)，不依賴(lài)假設(shè)；c)靈敏度極高，可定量檢測(cè)核酸; d）可檢測(cè)基因組的任一部分。因此，mNGS上機(jī)測(cè)序的核酸樣本非常關(guān)鍵，確保無(wú)外源核酸的污染。
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撰稿人：王艷芝 | 修訂：彭穎靜
